Năm 2019, Trường đại học Tôn Đức Thắng công bố 2.130 công trình nghiên cứu khoa học, là một trong 10 cơ sở giáo dục đại học của Đông Nam Á đứng đầu về số lượng công trình công bố trên các tạp chí ISI, theo số liệu của cơ sở dữ liệu Web of Science (Hoa Kỳ) năm 2019.